Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms