Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Parp3Q3ULW8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp3Q3ULW8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms