Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gbp8Q2V6D6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gbp8Q2V6D6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gbp8Q2V6D6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gbp8Q2V6D6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gbp8Q2V6D6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp8Q2V6D6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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