Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ebf1Q07802 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms