Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox12Q04890 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms