Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitx2P97474 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms