Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SgcgP82348 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SgcgP82348 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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SgcgP82348 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SgcgP82348 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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