Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx1P81068 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Irx1P81068 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irx1P81068 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx1P81068 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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