Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb1P70662 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ldb1P70662 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ldb1P70662 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb1P70662 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb1P70662 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms