Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp5P56399 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms