Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp1P55194 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp1P55194 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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