Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TspoP50637 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TspoP50637 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TspoP50637 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TspoP50637 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TspoP50637 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TspoP50637 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TspoP50637 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TspoP50637 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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