Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfaP48030 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms