Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGIRP43119 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms