Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HmgclP38060 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HmgclP38060 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HmgclP38060 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HmgclP38060 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HmgclP38060 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HmgclP38060 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HmgclP38060 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HmgclP38060 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HmgclP38060 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HmgclP38060 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HmgclP38060 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HmgclP38060 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HmgclP38060 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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HmgclP38060 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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HmgclP38060 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HmgclP38060 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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