Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Celf1P28659 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Celf1P28659 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Celf1P28659 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Celf1P28659 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Celf1P28659 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Celf1P28659 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Celf1P28659 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Celf1P28659 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Celf1P28659 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Celf1P28659 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Celf1P28659 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Celf1P28659 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms