Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vav1P27870 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vav1P27870 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vav1P27870 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vav1P27870 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vav1P27870 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms