Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nfkb1P25799 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms