Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UbbP0CG49 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UbbP0CG49 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.8 ms