Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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PtprcP06800 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprcP06800 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprcP06800 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprcP06800 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprcP06800 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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PtprcP06800 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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PtprcP06800 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtprcP06800 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms