Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dync1i1O88485 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms