Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Kcns1O35173 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kcns1O35173 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kcns1O35173 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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