Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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H2-Q1O19441 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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H2-Q1O19441 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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H2-Q1O19441 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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H2-Q1O19441 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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H2-Q1O19441 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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H2-Q1O19441 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H2-Q1O19441 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H2-Q1O19441 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Q1O19441 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H2-Q1O19441 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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