Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm379J3QQ19 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm379J3QQ19 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms