Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Acp1-201ENSMUST00000062740 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Gm21887J3QQ04 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Gm21887J3QQ04 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
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