Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BC024978J3QPC3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BC024978J3QPC3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms