Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc4lG5E8X2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc4lG5E8X2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms