Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Farp1F8VPU2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms