Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Myo5cE9Q1F5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Myo5cE9Q1F5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms