Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uhrf1bp1B2KF50 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms