Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Plcb2A3KGF7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Plcb2A3KGF7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms