Protein–RNA interactions for Protein: A2AG10

Nup62cl, Nucleoporin 62 C-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62clA2AG10 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup62clA2AG10 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms