Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vstm4T1NXB5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm4T1NXB5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms