Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd4Q9Z2D7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd4Q9Z2D7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms