Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nrf1Q9WU00 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms