Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
AatfQ9JKX4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AatfQ9JKX4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms