Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scube2Q9JJS0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scube2Q9JJS0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scube2Q9JJS0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scube2Q9JJS0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scube2Q9JJS0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scube2Q9JJS0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scube2Q9JJS0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scube2Q9JJS0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scube2Q9JJS0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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