Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLSTN2Q9H4D0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms