Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ush1cQ9ES64 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ush1cQ9ES64 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ush1cQ9ES64 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ush1cQ9ES64 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ush1cQ9ES64 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ush1cQ9ES64 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ush1cQ9ES64 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ush1cQ9ES64 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms