Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Usp29Q9ES63 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp29Q9ES63 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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