Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrpraQ9DBG7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms