Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed3Q9D0L1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed3Q9D0L1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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