Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shmt2Q9CZN7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Shmt2Q9CZN7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Shmt2Q9CZN7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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