Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms