Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cnot11Q9CWN7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot11Q9CWN7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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