Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Smurf1Q9CUN6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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