Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufb9Q9CQJ8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms