Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tsnaxip1Q99P25 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms