Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pagr1aQ99L02 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms