Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A9Q96Q91 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A9Q96Q91 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms